Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
HDAC9Q9UKV0 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HDAC9Q9UKV0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms