Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
USP21Q9UK80 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP21Q9UK80 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms