Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SALL4Q9UJQ4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms