Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD71

PPP1R1B, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1BQ9UD71 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R1BQ9UD71 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP1R1BQ9UD71 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms