Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DLL3Q9NYJ7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms