Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA1

SPHK1, Sphingosine kinase 1, humanhuman

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Length 384 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1Q9NYA1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SPHK1Q9NYA1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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