Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
FZD3Q9NPG1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 235.9 ms