Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
C11orf49Q9H6J7 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C11orf49Q9H6J7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms