Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TMEM38AQ9H6F2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM38AQ9H6F2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM38AQ9H6F2 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM38AQ9H6F2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM38AQ9H6F2 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM38AQ9H6F2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM38AQ9H6F2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM38AQ9H6F2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM38AQ9H6F2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM38AQ9H6F2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM38AQ9H6F2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM38AQ9H6F2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TMEM38AQ9H6F2 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms