Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR1

SENP6, Sentrin-specific protease 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6Q9GZR1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SENP6Q9GZR1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SENP6Q9GZR1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms