Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
FOXQ1Q9C009 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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FOXQ1Q9C009 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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FOXQ1Q9C009 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
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FOXQ1Q9C009 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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FOXQ1Q9C009 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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FOXQ1Q9C009 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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FOXQ1Q9C009 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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FOXQ1Q9C009 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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FOXQ1Q9C009 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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FOXQ1Q9C009 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
FOXQ1Q9C009 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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