Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
BCO2Q9BYV7 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
BCO2Q9BYV7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms