Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SCAPERQ9BY12 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SCAPERQ9BY12 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms