Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
FYCO1Q9BQS8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
FYCO1Q9BQS8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms