Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TREX2Q9BQ50 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms