Protein–RNA interactions for Protein: Q99666

RGPD5, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 5/6, humanhuman

Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD5Q99666 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RGPD5Q99666 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD5Q99666 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms