Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SMG1Q96Q15 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMG1Q96Q15 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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