Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM227BQ96M60 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FAM227BQ96M60 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms