Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ZNF354BQ96LW1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms