Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
EP400Q96L91 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EP400Q96L91 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms