Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATG4CQ96DT6 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATG4CQ96DT6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms