Protein–RNA interactions for Protein: Q96CF2

CHMP4C, Charged multivesicular body protein 4c, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4CQ96CF2 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4CQ96CF2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4CQ96CF2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms