Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMIEQ8NEW7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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TMIEQ8NEW7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
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TMIEQ8NEW7 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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TMIEQ8NEW7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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TMIEQ8NEW7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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TMIEQ8NEW7 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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TMIEQ8NEW7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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TMIEQ8NEW7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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TMIEQ8NEW7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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TMIEQ8NEW7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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TMIEQ8NEW7 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMIEQ8NEW7 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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