Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CHCHD4Q8N4Q1 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHCHD4Q8N4Q1 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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