Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y8

KRT27, Keratin, type I cytoskeletal 27, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT27Q7Z3Y8 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KRT27Q7Z3Y8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KRT27Q7Z3Y8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms