Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
STRCQ7RTU9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
STRCQ7RTU9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms