Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHX8Q68G74 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms