Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRCH2Q5VUJ6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRCH2Q5VUJ6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms