Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CEP350Q5VT06 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms