Protein–RNA interactions for Protein: Q5MIZ7

PPP4R3B, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3B, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R3BQ5MIZ7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPP4R3BQ5MIZ7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPP4R3BQ5MIZ7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms