Protein–RNA interactions for Protein: Q5JV73

FRMPD3, FERM and PDZ domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD3Q5JV73 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FRMPD3Q5JV73 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FRMPD3Q5JV73 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms