Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CAVIN4Q5BKX8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms