Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NBPF8Q3BBV2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NBPF8Q3BBV2 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms