Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CHRNA6Q15825 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CHRNA6Q15825 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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