Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
R3HDM1Q15032 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
R3HDM1Q15032 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
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