Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PSMD6Q15008 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
PSMD6Q15008 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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