Protein–RNA interactions for Protein: Q13972

RASGRF1, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF1Q13972 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RASGRF1Q13972 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASGRF1Q13972 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RASGRF1Q13972 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms