Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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DNASE1L3Q13609 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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DNASE1L3Q13609 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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DNASE1L3Q13609 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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DNASE1L3Q13609 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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DNASE1L3Q13609 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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DNASE1L3Q13609 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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DNASE1L3Q13609 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
DNASE1L3Q13609 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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