Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFIAQ12857 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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