Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMARCB1Q12824 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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