Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TROQ12816 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TROQ12816 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TROQ12816 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TROQ12816 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TROQ12816 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
TROQ12816 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TROQ12816 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TROQ12816 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TROQ12816 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TROQ12816 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TROQ12816 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TROQ12816 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TROQ12816 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TROQ12816 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TROQ12816 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TROQ12816 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TROQ12816 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TROQ12816 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TROQ12816 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TROQ12816 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TROQ12816 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TROQ12816 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
TROQ12816 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
TROQ12816 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TROQ12816 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TROQ12816 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TROQ12816 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TROQ12816 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TROQ12816 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TROQ12816 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TROQ12816 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TROQ12816 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TROQ12816 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TROQ12816 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
TROQ12816 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TROQ12816 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TROQ12816 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TROQ12816 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TROQ12816 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TROQ12816 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TROQ12816 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TROQ12816 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TROQ12816 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TROQ12816 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TROQ12816 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TROQ12816 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TROQ12816 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TROQ12816 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TROQ12816 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TROQ12816 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TROQ12816 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TROQ12816 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TROQ12816 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TROQ12816 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TROQ12816 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TROQ12816 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TROQ12816 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TROQ12816 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TROQ12816 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TROQ12816 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TROQ12816 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TROQ12816 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TROQ12816 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TROQ12816 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TROQ12816 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
TROQ12816 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TROQ12816 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TROQ12816 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TROQ12816 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
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