Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC173Q0VFZ6 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC173Q0VFZ6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms