Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PDE4BQ07343 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms