Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
FMODQ06828 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
FMODQ06828 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
FMODQ06828 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FMODQ06828 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FMODQ06828 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms