Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
UBE3AQ05086 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
UBE3AQ05086 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms