Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
OTUD4Q01804 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms