Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CACNA1BQ00975 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms