Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CDK16Q00536 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDK16Q00536 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms