Protein–RNA interactions for Protein: P60411

KRTAP10-9, Keratin-associated protein 10-9, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-9P60411 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP10-9P60411 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms