Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOX10P56693 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX10P56693 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX10P56693 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX10P56693 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOX10P56693 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOX10P56693 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOX10P56693 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX10P56693 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms